北京協(xié)和醫(yī)學院本科招生共設(shè)有兩個專業(yè)：臨床醫(yī)學專業(yè)（八年制）和護理專業(yè)。其中臨床醫(yī)學專業(yè)納入清華大學招生，前兩年半預(yù)科階段在清華學習，后五年半在協(xié)和本部學習。2010年在京招收15名理科生，考生在填報志愿時應(yīng)填報清華大學臨床醫(yī)學專業(yè)，并可同時填報清華大學其他專業(yè)。

　　報考護理專業(yè)的考生應(yīng)填報北京協(xié)和醫(yī)學院，護理本科計劃在京招收25名理科高中畢業(yè)生。護理?？迫孔咦x，計劃在京招生80人，可招收文、理科高中畢業(yè)生（其中文科20人，理科60人）。護理專科按照高會統(tǒng)招的形式錄取，會考要求物理、化學成績合格，高考的科目為語文、數(shù)學、英語，錄取時按照三科總成績排隊。成績優(yōu)秀的專科學生有機會在第五學期末升本。